Специфика деятельности ОАО «МСЗ» диктует необходимость повышенного внимания к вопросам безопасности производства.  Работа по обеспечению безопасности проводится в соответствии с требованиями нормативной документации, лицензиями Ростехнадзора РФ и рекомендациями Института биофизики. Специалисты ГНЦ ИБФ постоянно осуществляют радиационно-гигиеническое сопровождение работ на заводе, анализируют и прогнозируют состояние радиационной обстановки.

Кроме того, в настоящее время требования радиационной безопасности на заводе обеспечиваются целым комплексом мероприятий. Все подразделения завода, занятые в цикле производства топлива, а также транспортные средства для его перевозки имеют специальные санитарно-эпидемиологические заключения. Исходное сырье подвергается многостороннему входному контролю.

Вместе с тем установлены контрольные уровни (значительно ниже предельных значений) загрязненности внешних поверхностей оборудования, полов и стен производственных помещений, а также объемной активности аэрозолей в воздухе рабочей зоны. Кроме того, осуществляется постоянных контроль параметров радиационной безопасности, в частности, контроль доз внешнего гамма-облучения персонала, имеющего непосредственный контакт  с активными компонентами. Для остального персонала контроль доз производится на рабочем месте.

Для определения аварийных доз персонал ядерно-опасных участков оснащен аварийными дозиметрами ИКС.

На заводе организовано измерение альфа-активности аэрозолей в воздухе на рабочих местах, которое производится на 450 специализированных точках пробоотбора.

На  предприятии действует  лаборатория радиационной безопасности, которая контролирует и предупреждает поступление радионуклидов в организм людей.

Все работающие с источниками ионизирующего излучения проходят ежегодные профилактические медицинские осмотры. В течение последних десятилетий на предприятии не вывялено ни одного случая профзаболевания, вызванного воздействием ионизирующего излучения, что говорит о надлежащем функционировании систему обеспечения радиационной безопасности на предприятии.

Руководство ОАО «МСЗ» постоянно уделяет внимание вопросам уменьшения воздействия радионуклидов на персонал предприятия, население и окружающую среду. Кардинальное решение этих вопросов возможно только путем внедрения новых технологических процессов и автоматики, как в основном производстве, так и в обращении с оборотами и отходами производства. И работа в этом направлении ведется.

Технических решения, реализованные на участке «Сухой конверсии», введенном в эксплуатацию в 2003 году, позволяют  на порядок уменьшить объемную активность аэрозолей обогащенного урана в воздухе рабочей зоны и загрязненность рабочих поверхностей.

Заводскими специалистами создана и внедрена в эксплуатацию печь «Питон» для сжигания твердых промышленных и радиоактивных отходов.

Ведутся работы по переводу производств в корпуса, оснащенные новым оборудованием и имеющие более рациональную для уменьшения воздействия радионуклидов на персонал и население, планировку.